船舶職員及び小型船舶操縦者法関係の申請手数料
各種申請手数料
操縦試験手数料
平成１８年４月１日施行
| 試験種別 | 身体検査 | 学科試験 | 実技試験 | 登録免許税 | |
| １ | 一級小型船舶操縦士 | ３，２００円 | ５，９００円 | １８，６００円 | ２，０００円 |
| ２ | 二級小型船舶操縦士 | ３，２００円 | ３，０００円 | １８，６００円 | １，８００円 |
| ３ | 二級小型船舶操縦士（第一号限定） | ３，２００円 | ２，２００円 | １４，７００円 | １，８００円 |
| ４ | 二級小型船舶操縦士（第二号限定） | ３，２００円 | ３，０００円 | １８，６００円 | １，８００円 |
| ５ | 特殊小型船舶操縦士 | ３，２００円 | ２，６００円 | １６，０００円 | １，５００円 |
海技試験手数料
平成１６年３月３１日施行
| 試験種別 | 身体検査 | 学科試験 | 登録免許税 | ||
| 筆記試験 | 口述試験 | ||||
| １ | 一級海技士（航・機） | ８７０円 | ７，２００円 | ７，５００円 | １５，０００円 |
| ２ | 二級海技士（航・機） | ８７０円 | ７，２００円 | ７，５００円 | ９，０００円 |
| ３ | 三級海技士（航・機） | ８７０円 | ５，４００円 | ５，５００円 | ９，０００円 |
| ４ | 四級海技士（航・機） | ８７０円 | ３，５００円 | ３，７００円 | ４，５００円 |
| ５ | 五級海技士（航・機） | ８７０円 | ３，５００円 | ３，７００円 | ３，０００円 |
| ６ | 六級海技士（航・機） | ８７０円 | ２，４００円 | ３，０００円 | ２，１００円 |
| ７ | 一級海技士（通信・電子通信） 二級海技士（電子通信） 三級海技士（電子通信） |
８７０円 | ５，０００円 | − | ７，５００円 |
| ８ | 二級海技士（通信） | ８７０円 | ３，４００円 | − | ６，０００円 |
| ９ | 三級海技士（通信） 四級海技士（電子通信） |
８７０円 | ２，７００円 | − | ２，１００円 |
その他の申請手数料
平成１７年４月１日施行
| 申請種別 | 手数料・登録免許税 | ||
| 小型免状（操縦免許証） | 大型免状（海技免状） | ||
| １ | 有効期間の更新 | １，３５０円 | １，７００円 |
| ２ | 再交付（失効・滅失等） | １，２５０円 | １，５００円 |
| ３ | 設備等限定（小型）の解除 履歴限定（大型）の解除等及び能力限定（大型）の解除 |
１，２５０円 | １，３００円 |
| ４ | 登録事項の訂正・変更 | １，２５０円 | １，０００円 |
